Las comisiones de trabajo de COMUDE son el espacio donde se lleva a cabo la coordinación entre instituciones sectores y comunidades, para la planificación del desarrollo municipal.
Su función es analizar, emitir opinión sobre temas y asuntos específicos antes de ser trasladados Asamblea General de los COMUDE y proponer soluciones conjuntas a la problemática que afectan a las comunidades y al municipio.
Por esta razón y dando importancia a la Participación Ciudadana en el marco del Fortalecimiento Municipal se llevan a cabo diversas reuniones con las 8 comisiones de trabajo de COMUDE y sus respectivos integrantes.